Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms