Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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