Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms