Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT28Q7Z3Y7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms