Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRCQ7RTU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRCQ7RTU9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms