Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP47Q6ZTR5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CFAP47Q6ZTR5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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