Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTE2Q6XPS3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms