Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUSD1Q6UWL2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUSD1Q6UWL2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms