Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZBED9Q6R2W3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms