Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAAP20Q6NZ36 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms