Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
INTS3Q68E01 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms