Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG9BQ674R7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms