Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LINC01545Q5VT33 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms