Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms