Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL12Q53G59 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms