Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TBRG1Q3YBR2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms