Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HFEQ30201 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HFEQ30201 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HFEQ30201 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HFEQ30201 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms