Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL38Q2WGJ6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL38Q2WGJ6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms