Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FHOD3Q2V2M9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FHOD3Q2V2M9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms