Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KNOP1Q1ED39 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KNOP1Q1ED39 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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