Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2B3Q16720 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2B3Q16720 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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