Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FXNQ16595 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FXNQ16595 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FXNQ16595 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FXNQ16595 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms