Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNAPC1Q16533 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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