Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK5Q16478 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIK5Q16478 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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