Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNHIT3Q15649 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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