Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NCF4Q15080 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms