Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNIP1Q15025 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms