Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

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Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCAPD2Q15021 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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