Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSHL1Q14406 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms