Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERV3-1Q14264 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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