Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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