Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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