Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMB3Q13751 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMB3Q13751 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms