Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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