Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL1Q13616 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CUL1Q13616 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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