Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
STRN3Q13033 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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