Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTP4A2Q12974 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms