Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KIF5AQ12840 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KIF5AQ12840 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms