Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXO1Q12778 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXO1Q12778 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXO1Q12778 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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