Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms