Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CALD1Q05682 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms