Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms