Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP7AQ04656 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms