Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms