Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP4A11Q02928 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms