Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OTUD4Q01804 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms