Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CAP1Q01518 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAP1Q01518 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms