Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MS4A2Q01362 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms