Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F1Q01094 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms