Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
B4GALNT1Q00973 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
B4GALNT1Q00973 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms